Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1587 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1587
← Back to portal
Lactobacillus helveticus "Bacillus casei e" von Freudenreich and Thoni 1904
⚡ 10 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 43 linked cheese matrix/matrices • 🧊 12 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Lactobacillales (order)
› Lactobacillaceae (family)
› Lactobacillus (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (43) :
🧀 Abondance
🧀 Alfred le fermier
🧀 Asiago
🧀 Beaufort
🧀 Bitto
🧀 Blue cheese
🧀 Bries
🧀 Caciocavallo
🧀 Caciocavallo Silano
🧀 Cheddar cheese
🧀 Cheese core
🧀 Comté
🧀 Emmentaler
🧀 Fontina
🧀 Fresh cheeses
🧀 Grana Padano
🧀 Grana Padano
🧀 Hercule de Charlevoix
🧀 Idiazabal
🧀 Kefir
🧀 Whey
🧀 Louis Cyr
🧀 Louis d'Or
🧀 Maasdam
🧀 Montasio
🧀 Mozzarella
🧀 Mozzarella
🧀 Mozzarella di Bufala Campana
🧀 Parmigiano-Reggiano
🧀 Parmigiano-Reggiano
🧀 Pecorino
🧀 Pecorino Romano
🧀 Pecorino Romano
🧀 Pecorino sardo
🧀 Pionnier
🧀 Provolone
INDEX-EXPERT™ #00 • Tyrodexia™ Cheese Core
Palier 1
Master index of cheese starters and ripening cultures
🔎 SQLite Proof
| Associated dairy & cheese matrices | Parmigiano Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Grana Padano [en:grana-padano], Comté [en:comte], Beaufort [en:beaufort], Emmentals [en:emmentaler], Mozzarella [en:mozzarella], Mozzarella di Bufala Campana [en:mozzarella-di-bufala-campana], Pecorino Romano [en:pecorino-romano] |
|---|---|
| Paste typology & technological evidence | Ferment thermophile majeur du siero-innesto assurant la protéolyse profonde, la libération d'acides aminés libres et la cristallogenèse de tyrosine ; Ferment thermophile dominant du siero-innesto assurant l'acidification post-cuisson et la protéolyse en pâte cuite ; Protéolyse primaire intense et maîtrise de l'élasticité de la pâte lors du pressage et de la cave chaude • Bacteria • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Secondary metabolites & reference collections | GCA_018408455.1 |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Matrix TDM % & FDM % | Taille: 2.26128 Mb • GC: 36.9 % • "Bacillus casei e" von Freudenreich and Thoni 1904 |
| Predatory bacteriophages & PubMed literature | Phages: Lactobacillus phage CR191, Lactobacillus phage CR28, Lactobacillus phage CV244, Lactobacillus phage P185, Lactobacillus phage phiAQ113, Lactobacillus phage S16 |
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Lactobacillus helveticus ⟷ Bacillus casei e • Bacillus e • Caseobacterium e • Lactobacillus helveticum • Lactobacillus suntoryeus • Lactobacterium helveticum • Plocamobacterium helveticum • Thermobacterium helveticum |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Bacillus casei e" von Freudenreich and Thoni 1904 |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
INDEX-EXPERT™ #02 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Ecological origins and habitats
🔎 SQLite Proof
| Cheese biotope, terroirs & isolation substrates | Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio], Louis Cyr [qc:louis-cyr], Idiazabal [es:idiazabal] • Italie ; France — Cantal — Puy-de-Dôme ; France ; Espagne — Alava — Guipuscoa ; Italie — Campanie — Molise |
|---|---|
| Deposited strains & reference collections | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Protéolyse profonde des caséines ovines et bovines générant une richesse umami, des notes d'oignon caramélisé et des cristaux de tyrosine ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) |
| Colonized matrix TDM % & FDM % | Bitto (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Salers (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) • Bacteria |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
INDEX-EXPERT™ #03 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 2
Paste textures and rheology
🔎 SQLite Proof
| Paste/rind typology & linked matrices | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio] • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Protéolyse profonde des caséines ovines et bovines générant une richesse umami, des notes d'oignon caramélisé et des cristaux de tyrosine ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) |
|---|---|
| Proteolytic profile, amino acids (USDA) & metabolites | Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g ; Aspartic acid : 0.666 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Dry matter (TDM %), FDM %, Ca/P ratio & mineralization | Bitto (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Salers (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) • Iron, Fe : 0.52 mg ; Magnesium, Mg : 21 mg ; Phosphorus, P : 126 mg ; Sodium, Na : 371 mg |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Guide clinique de la rhéologie fromagère et des matrices coagulées (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #04 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Cheese families and technologies
🔎 SQLite Proof
| Technological family & associated appellations | Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte pressée non cuite ; Fromages de Suisse • Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio], Louis Cyr [qc:louis-cyr], Idiazabal [es:idiazabal] |
|---|---|
| Paste/rind diagram & technological function | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Protéolyse profonde des caséines ovines et bovines générant une richesse umami, des notes d'oignon caramélisé et des cristaux de tyrosine ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Total dry matter (TDM %) & Fat in dry matter (FDM %) | Bitto (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Asiago (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Salers (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) • Bacteria |
| Flagship cheeses (PDO / Caseus) & PubMed studies | Bitto (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Salers (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) |
INDEX-EXPERT™ #05 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Technological markers (pH and gas)
🔎 SQLite Proof
| Carbohydrate substrates, residual lactose (USDA) & metabolites | Protein : 7.96 g ; Ash : 1.63 g ; Lactose : 1.91 g ; Fiber, total dietary : 1.4 g • Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio] |
|---|---|
| Metabolic role & characterized compounds | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Protéolyse profonde des caséines ovines et bovines générant une richesse umami, des notes d'oignon caramélisé et des cristaux de tyrosine ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Draining, moisture, salting (USDA) & linked matrices | Bitto (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Asiago (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Salers (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, NaCl 2.03 g/100g) • Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio] |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Vat phage monitoring & PubMed references | Phages: Lactobacillus phage CR191 (TaxID:3035944), Lactobacillus phage CR28 (TaxID:3035945), Lactobacillus phage CV244 (TaxID:3035946), Lactobacillus phage P185 (TaxID:3035947), Lactobacillus phage S16 (TaxID:3035948) |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Protéolyse profonde des caséines ovines et bovines générant une richesse umami, des notes d'oignon caramélisé et des cristaux de tyrosine ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio], Louis Cyr [qc:louis-cyr], Idiazabal [es:idiazabal] • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Bitto (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Asiago (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Salers (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) • "Bacillus casei e" von Freudenreich and Thoni 1904 • Bacillus casei e • Bacillus e • Caseobacterium e • Lactobacillus helveticum • Lactobacillus suntoryeus • Lactobacterium helveticum • Plocamobacterium helveticum • Thermobacterium helveticum |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #10 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 1
Terroirs and protected designations (PDO/PGI)
🔎 SQLite Proof
| Linked cheeses & dairy basins of origin | Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio], Louis Cyr [qc:louis-cyr], Idiazabal [es:idiazabal] • Italie ; France — Cantal — Puy-de-Dôme ; France ; Espagne — Alava — Guipuscoa ; Italie — Campanie — Molise |
|---|---|
| Official designations (PDO/PGI) & rinds | Bitto (Appellation d'origine protégée) ; Asiago (Appellation d'origine protégée) ; Salers (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Pionnier (Indicazione geografica protetta) • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Terroir cheesemakers & official awards | "Bacillus casei e" von Freudenreich and Thoni 1904 |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Reference collections, BioSample & BioProject | SAMN35073037 • PRJNA972326 |
INDEX-EXPERT™ #11 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Volatilome and aromatic profiles
🔎 SQLite Proof
| Bridge aroma compounds (FlavorGraph) & volatiles | trimethylamine ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; oleic acid ; octanoic acid ; methanethiol • Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio] |
|---|---|
| Lipid & amino acid aroma precursors (USDA) | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Protéolyse profonde des caséines ovines et bovines générant une richesse umami, des notes d'oignon caramélisé et des cristaux de tyrosine ; Microbiote fromager caractérisé (8 éch.) • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Gastronomic pairings & sensory affinities | Lasagna Noodle ; Manicotti ; Pepperoni ; Crushed Tomato ; Tomato Paste ; Ground Beef ; Bacon Bit • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
INDEX-EXPERT™ #14 • Tyrodexia™ Milk Science & Health
Palier 4
Bioactive peptidome, functional health and clinical vigilance
🔎 SQLite Proof
| Cardioprotective vitamins (USDA) & bioactives | Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg ; Cryptoxanthin, beta : 0 µg |
|---|---|
| Functional amino acids (GABA, Proline USDA) | Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g ; Aspartic acid : 0.666 g ; Lysine : 0.598 g ; Serine : 0.46 g • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Lactobacillales (order) › Lactobacillaceae (family) › Lactobacillus (genus) |
| Bioactive fatty acids (CLA, Omega-3) & minerals | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Iron, Fe : 0.52 mg ; Magnesium, Mg : 21 mg ; Phosphorus, P : 126 mg ; Sodium, Na : 371 mg • Bitto [it:bitto], Asiago [en:asiago], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Fontina [en:fontina], Pionnier [qc:pionnier], Montasio [it:montasio] |
| Actual lactose extinction & sugars (USDA) | Fiber, total dietary : 1.4 g ; Total lipid (fat) : 6 g ; Carbohydrate, by difference : 17.6 g ; Énergie : 156 kcal ; Glucose : 1.18 g |
| Reference collections, authority & synonyms | "Bacillus casei e" von Freudenreich and Thoni 1904 • Bacillus casei e • Bacillus e • Caseobacterium e • Lactobacillus helveticum • Lactobacillus suntoryeus • Lactobacterium helveticum • Plocamobacterium helveticum • Thermobacterium helveticum |
| Official sources & reference book | TaxID:1587 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Bacillus casei e • Bacillus e • Caseobacterium e • Lactobacillus helveticum • Lactobacillus suntoryeus • Lactobacterium helveticum • Plocamobacterium helveticum • Thermobacterium helveticum |
|---|
🔬 Subordinate strains and subspecies qualified in Tyrodexia™ (13) :
🦠 Lactobacillus helveticus CIRM-BIA 101
#1226336
🦠 Lactobacillus helveticus CIRM-BIA 103
#1226332
🦠 Lactobacillus helveticus CIRM-BIA 104
#1226333
🦠 Lactobacillus helveticus CIRM-BIA 951
#1226334
🦠 Lactobacillus helveticus CIRM-BIA 953
#1226335
🦠 Lactobacillus helveticus CNRZ32
#326425
🦠 Lactobacillus helveticus DPC 4571
#405566
🦠 Lactobacillus helveticus DSM 20075 = CGMCC 1.1877
#585520
🦠 Lactobacillus helveticus H10
#767462
🦠 Lactobacillus helveticus H9
#767456
🦠 Lactobacillus helveticus MTCC 5463
#947827
🦠 Lactobacillus helveticus R0052
#880633
🦠 Lactobacillus helveticus subsp. jugurti
#44272
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #10BV (12 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_018408455.1 • Taille: 2.26128 Mb • GC: 36.9 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN35073037 • BioProject: PRJNA972326 |
📊 Quantitative Metagenomic Detections (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=320)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:kefir (n=142)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:parmigiano-reggiano (n=108)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheddar-cheese (n=70)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:provolone (n=24)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:caciocavallo (n=22)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino (n=18)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:maasdam (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:mozzarella (n=10)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:montasio (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:provolone-del-monaco (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:grana-padano (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheese-core (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:blue-cheese (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:yogurts (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:asiago (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:pecorino-sardo (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:pecorino-romano (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:caciocavallo-silano (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:provolone-valpadana (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
it:castelmagno (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:whey (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fontina (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:bries (n=2)