STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) 24-pole relational architecture & 17 Index-Experts™ synchronized with NCBI 2026 taxonomy, EBI SIFTS 3D and cFMD/FMBN.
TYRODEXIA™ & NCBI 2026
The Grand Dictionary of the Cheese Microbiome
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1158108 • SPECIES • Plants and Fungi 🔎 NCBI Certificate #1158108
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Sporendonema casei Sporendonema casei Desm. 1827

⚡ 8 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing)  •  🧀 3 linked cheese matrix/matrices

🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Onygenales (order) › Gymnoascaceae (family) › Sporendonema (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (3) :
🧀 Cantal 🧀 Ossau-Iraty cheeses 🧀 Salers cheese
INDEX-EXPERT™ #00 • Tyrodexia™ Cheese Core Palier 1

Master index of cheese starters and ripening cultures

🔎 SQLite Proof
Associated dairy & cheese matrices Cantal [en:cantal], Salers [en:salers-cheese], Ossau-Iraty [en:ossau-iraty-cheeses]
Paste typology & technological evidence Moisissure xerotolérante formant les pustules et taches rouge-orangé (”fleur rouge”) sur la croûte boutonnée du Cantal ; Fleur rouge-orangé boutonnant la croûte dorée de la fourme de Salers au cours de l'affinage sur bois ; Fleur rouge-orangé naturelle colonisant la croûte brossée jaune-orangé à gris-cendré des tommes basques et béarnaises • Plants and Fungi • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Onygenales (order) › Gymnoascaceae (family) › Sporendonema (genus)
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Matrix TDM % & FDM % Sporendonema casei Desm. 1827
Predatory bacteriophages & PubMed literature PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture Palier 5

Synonyms and historical names (NCBI)

🔎 SQLite Proof
Nomenclature concordance (NCBI) Sporendonema casei ⟷ Torula sporendonema
Historical synonyms & basionyms Plants and Fungi
Taxonomic authority & reference strains Sporendonema casei Desm. 1827
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Lineage & phylogenomic justification Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Onygenales (order) › Gymnoascaceae (family) › Sporendonema (genus)
PubMed taxonomic references PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #02 • Tyrodexia™ Architecture Palier 2

Ecological origins and habitats

🔎 SQLite Proof
Cheese biotope, terroirs & isolation substrates Cantal [en:cantal], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Ossau-Iraty / Ossau-Iraty cheeses [en:ossau-iraty-cheeses]
Deposited strains & reference collections Moisissure xerotolérante formant les pustules et taches rouge-orangé (”fleur rouge”) sur la croûte boutonnée du Cantal ; Fleur rouge-orangé boutonnant la croûte dorée de la fourme de Salers au cours de l'affinage sur bois ; Fleur rouge-orangé naturelle colonisant la croûte brossée jaune-orangé à gris-cendré des tommes basques et béarnaises
Colonized matrix TDM % & FDM % Cantal (EST 60.4 %, G/S 50.83 %) ; Salers (EST 12.1 %, G/S 26.86 %) ; Ossau-Iraty (EST 83.8 %, G/S 96.78 %) • Plants and Fungi
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Ecology & PubMed references PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #04 • Tyrodexia™ Architecture Palier 1

Cheese families and technologies

🔎 SQLite Proof
Technological family & associated appellations Camemberts au lait de vache ; Fromages pasteurisés ; Yaourts ; Beurres demi-sel • Cantal [en:cantal], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Ossau-Iraty / Ossau-Iraty cheeses [en:ossau-iraty-cheeses]
Paste/rind diagram & technological function Moisissure xerotolérante formant les pustules et taches rouge-orangé (”fleur rouge”) sur la croûte boutonnée du Cantal ; Fleur rouge-orangé boutonnant la croûte dorée de la fourme de Salers au cours de l'affinage sur bois ; Fleur rouge-orangé naturelle colonisant la croûte brossée jaune-orangé à gris-cendré des tommes basques et béarnaises • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Onygenales (order) › Gymnoascaceae (family) › Sporendonema (genus)
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Total dry matter (TDM %) & Fat in dry matter (FDM %) Cantal (EST 60.4 %, G/S 50.83 %) ; Salers (EST 12.1 %, G/S 26.86 %) ; Ossau-Iraty (EST 83.8 %, G/S 96.78 %) • Plants and Fungi
Flagship cheeses (PDO / Caseus) & PubMed studies PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture Palier 4

Pathogens and bioprotection

🔎 SQLite Proof
Bacteriocins (NPClassifier) & health targets Moisissure xerotolérante formant les pustules et taches rouge-orangé (”fleur rouge”) sur la croûte boutonnée du Cantal ; Fleur rouge-orangé boutonnant la croûte dorée de la fourme de Salers au cours de l'affinage sur bois ; Fleur rouge-orangé naturelle colonisant la croûte brossée jaune-orangé à gris-cendré des tommes basques et béarnaises • Plants and Fungi
Isolation substrates & linked cheese matrices Cantal [en:cantal], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Ossau-Iraty / Ossau-Iraty cheeses [en:ossau-iraty-cheeses] • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Onygenales (order) › Gymnoascaceae (family) › Sporendonema (genus)
Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) Cantal (EST 60.4 %, MNA 57.14 %, NaCl 4.24 g/100g) ; Salers (EST 12.1 %, MNA 90.85 %, NaCl 0.12 g/100g) ; Ossau-Iraty (EST 83.8 %, MNA 85.71 %, NaCl 1.63 g/100g) • Sporendonema casei Desm. 1827 • Torula sporendonema
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxis & PubMed references PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #09 • Tyrodexia™ Architecture Palier 3

Surface interactomes and syntrophy

🔎 SQLite Proof
Microbial consortium partners & matrices Lacticaseibacillus paracasei (TaxID:1597) ; Lactiplantibacillus plantarum (TaxID:1590) ; Lactococcus lactis (TaxID:1358) ; Lactococcus lactis subsp. lactis (TaxID:1360) ; Scopulariopsis flava (TaxID:186360) • Cantal [en:cantal], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Ossau-Iraty / Ossau-Iraty cheeses [en:ossau-iraty-cheeses]
Vitamin B1–B12 cofactors (USDA) & pigments Folic acid : 0 µg ; Vitamin E (alpha-tocopherol) : 0.8 mg ; Vitamin D (D2 + D3), International Units : 301 IU ; Vitamin D2 (ergocalciferol) : 0 µg ; Tocopherol, beta : 0 mg
Rind typology & ripening succession Moisissure xerotolérante formant les pustules et taches rouge-orangé (”fleur rouge”) sur la croûte boutonnée du Cantal ; Fleur rouge-orangé boutonnant la croûte dorée de la fourme de Salers au cours de l'affinage sur bois ; Fleur rouge-orangé naturelle colonisant la croûte brossée jaune-orangé à gris-cendré des tommes basques et béarnaises
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Consortium balance & PubMed studies PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #10 • Tyrodexia™ Architecture Palier 1

Terroirs and protected designations (PDO/PGI)

🔎 SQLite Proof
Linked cheeses & dairy basins of origin Cantal [en:cantal], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Ossau-Iraty / Ossau-Iraty cheeses [en:ossau-iraty-cheeses]
Official designations (PDO/PGI) & rinds Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Onygenales (order) › Gymnoascaceae (family) › Sporendonema (genus)
Terroir cheesemakers & official awards Sporendonema casei Desm. 1827
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Terroir audit & PubMed references PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎
INDEX-EXPERT™ #12 • Tyrodexia™ Architecture Palier 2

Affinage gestures and cellar care

🔎 SQLite Proof
Rind management, cellar care & matrices Moisissure xerotolérante formant les pustules et taches rouge-orangé (”fleur rouge”) sur la croûte boutonnée du Cantal ; Fleur rouge-orangé boutonnant la croûte dorée de la fourme de Salers au cours de l'affinage sur bois ; Fleur rouge-orangé naturelle colonisant la croûte brossée jaune-orangé à gris-cendré des tommes basques et béarnaises • Cantal [en:cantal], Salers / Salers cheese [en:salers-cheese], Ossau-Iraty / Ossau-Iraty cheeses [en:ossau-iraty-cheeses]
Moisture balance, dry matter & salting (USDA) Cantal (EST 60.4 %, NaCl 4.24 g/100g) ; Salers (EST 12.1 %, NaCl 0.12 g/100g) ; Ossau-Iraty (EST 83.8 %, NaCl 1.63 g/100g) • Plants and Fungi
Official sources & reference book TaxID:1158108 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Cellar studies & PubMed references PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎

⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)

Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):

⚠️ Red cellar spot (orange-red rind pocking) fungal agent
DEFAUT_AFFINAGE_CROUTE🔎 Proof
Coussinets et ponctuations poudreuses rouge brique à orangé vif en surface de la croûte (défaut sur les croûtes lisses ou lavées, bien que parfois …
View full 360° clinical card →

🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
NCBI Synonyms & Basionyms Torula sporendonema

🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
PubMed / DOI Primary Literature PMID:26432693 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.018 🔎