STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
TYRODEXIA™ & NCBI 2026
Grand dictionnaire du microbiome des fromages
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #910996 • STRAIN • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #910996
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Hafnia alvei ATCC 13337 "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963

⚡ 5 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 9 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)  •  🧊 8 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (9) :
🧀 Blue cheese 🧀 Camemberts 🧀 Camemberts 🧀 Fromages à pâte fraîche 🧀 Lactosérum 🧀 Livarot 🧀 Rocamadour 🧀 Sainte-Maure de Touraine 🧀 Selles-sur-Cher
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™ Palier 1

Index maître des ferments fromagers et affineurs

🔎 Preuve SQLite
Matrices fromagères & substrats associés Camemberts [en:camemberts], Lactosérum [en:whey], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche [en:fresh-cheeses], Rocamadour [en:rocamadour], Livarot [en:livarot], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher]
Typologie de pâte & preuves technologiques Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) • Bacteria • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus)
Métabolites secondaires & collections de référence GCA_003668715.1
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:910996 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
EST %, G/S % des matrices fromagères Taille: 4.81501 Mb • GC: 48.7 % • "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963
Bactériophages prédateurs & littérature PubMed Phages: Hafnia phage vB_HalM_SPARTY • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite
Concordance de nomenclature (NCBI) Hafnia alvei ATCC 13337 ⟷ Hafnia alvei CIP 57.31 • Hafnia alvei strain ATCC 13337 • Hafnia alvei str. ATCC 13337
Synonymes & basionymes historiques Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:910996 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus)
Références taxonomiques PubMed PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Familles de fromages et technologies

🔎 Preuve SQLite
Famille technologique & appellations associées Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte molle à croûte lavée ; Fromages de chèvre ; Fromages à pâte molle à croûte naturelle • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses]
Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:910996 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices Livarot (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Rocamadour (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) • Bacteria
Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed Livarot (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Rocamadour (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Selles-sur-Cher (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Sainte-Maure de Touraine (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎
INDEX-EXPERT™ #05 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Marqueurs technologiques (pH et gaz)

🔎 Preuve SQLite
Substrats glucidiques, lactose résiduel (USDA) & métabolites Total lipid (fat) : 10.8 g ; Carbohydrate, by difference : 25 g ; Énergie : 229 kcal ; Eau : 54.7 g • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey]
Rôle métabolique & composés caractérisés Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus)
Égouttage, humidité, salage (USDA) & matrices reliées Livarot (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) • Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey]
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:910996 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Surveillance phagique en cuve & références PubMed Phages: Hafnia phage vB_HalM_SPARTY (TaxID:2894718) • PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Entérobactérie bénigne du lait cru synthétisant les composés soufrés volatils (DMDS, DMTS) et esters fruités typiques du Camembert au lait cru ; Microbiote fromager caractérisé (4 éch.) • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Livarot [en:livarot], Rocamadour [en:rocamadour], Selles-sur-Cher [en:selles-sur-cher], Sainte-Maure de Touraine [en:sainte-maure-de-touraine], Camemberts [en:camemberts], Lactosérum / Whey [en:whey], Blue cheese [en:blue-cheese], Fromages à pâte fraîche / Fresh cheeses [en:fresh-cheeses] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Hafniaceae (family) › Hafnia (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Livarot (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Rocamadour (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Selles-sur-Cher (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Sainte-Maure de Touraine (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) • "Enterobacter aerogenes subsp. hafniae" Ewing 1963 • Hafnia alvei CIP 57.31 • Hafnia alvei strain ATCC 13337 • Hafnia alvei str. ATCC 13337
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:910996 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
Synonymes & Basionymes NCBI Hafnia alvei CIP 57.31 • Hafnia alvei strain ATCC 13337 • Hafnia alvei str. ATCC 13337

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB PDB #4ARO (8 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_003668715.1 • Taille: 4.81501 Mb • GC: 48.7 % • Statut: Contig • BioSample: SAMN02743263 • BioProject: PRJNA59557
Littérature primaire PubMed / DOI PMID:24359678 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2013.11.015 🔎