STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
TYRODEXIA™ & NCBI 2026
Grand dictionnaire du microbiome des fromages
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #5082 • SPECIES • Plants and Fungi 🔎 Certificat NCBI #5082
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Penicillium roqueforti Penicillium roqueforti Sopp, 1912

⚡ 10 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 12 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)  •  🧊 3 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (12) :
🧀 Bleu bénédictin 🧀 Bleu d'Élizabeth 🧀 Blue cheese 🧀 Cheese core 🧀 Danablu 🧀 Fourme d'Ambert 🧀 Fromages à pâte persillée 🧀 Gorgonzolas 🧀 Gorgonzolas 🧀 Roqueforts 🧀 Roqueforts 🧀 Stilton cheese
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™ Palier 1

Index maître des ferments fromagers et affineurs

🔎 Preuve SQLite
Matrices fromagères & substrats associés Roqueforts [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Fourme d'Ambert [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Bleu d'Élizabeth [qc:bleu-d-elizabeth], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin], Fromages à pâte persillée [en:blue-veined-cheeses], Blue cheese [en:blue-cheese]
Typologie de pâte & preuves technologiques Sporulation bleu-vert dans les ouvertures mécaniques, lipolyse intense des triglycérides ovins et β-oxydation en 2-heptanone et 2-nonanone ; Développement du persillage vert-bleuté (erborinatura) doux ou piquant après piquage aux aiguilles de cuivre ou d'inox ; Colonisation radiale des veines bleues depuis le cœur vers la croûte après piquage aux aiguilles d'acier • Plants and Fungi • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Métabolites secondaires & collections de référence GCA_030518555.1
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
EST %, G/S % des matrices fromagères Taille: 28.7545 Mb • GC: 48.1165 % • Penicillium roqueforti Sopp, 1912
Bactériophages prédateurs & littérature PubMed Phages: Penicillium roqueforti ssRNA mycovirus 1 • PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite
Concordance de nomenclature (NCBI) Penicillium roqueforti (Penicillium roqueforti Sopp, 1912)
Synonymes & basionymes historiques Plants and Fungi
Autorité taxonomique & souches de référence Penicillium roqueforti Sopp, 1912
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Références taxonomiques PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Origines et habitacles écologiques

🔎 Preuve SQLite
Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin] • Danemark ; France — Roquefort-sur-Soulzon ; Italie — Lombardie ; Royaume-Uni — Somerset ; Italie
Souches déposées & collections de référence Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume
EST %, G/S % des matrices colonisées Danablu (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Roqueforts (EST 60.6 %, G/S 50.5 %) ; Gorgonzolas (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Fourme d'Ambert (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) • Plants and Fungi
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Écologie & références PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #03 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Textures de pâte et rhéologie

🔎 Preuve SQLite
Typologie de pâte/croûte & matrices reliées Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core] • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume
Profil protéolytique, acides aminés (USDA) & métabolites Glutamic acid : 5.18 g ; Proline : 2.1 g ; Leucine : 1.92 g ; Lysine : 1.85 g • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Extrait sec (EST %), G/S %, ratio Ca/P & minéralisation Danablu (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Roqueforts (EST 60.6 %, G/S 50.5 %) ; Gorgonzolas (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Fourme d'Ambert (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) • Sodium, Na : 1150 mg ; Iron, Fe : 0.31 mg ; Magnesium, Mg : 23 mg ; Phosphorus, P : 387 mg
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Guide clinique de la rhéologie fromagère et des matrices coagulées (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Références rhéologiques PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Familles de fromages et technologies

🔎 Preuve SQLite
Famille technologique & appellations associées Fromages à pâte persillée ; Danish cheeses ; Fromages à pâte persillée français ; Fromages de brebis ; Fromages italiens • Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin]
Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices Danablu (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Roqueforts (EST 60.6 %, G/S 50.5 %) ; Gorgonzolas (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) ; Fourme d'Ambert (EST 57.6 %, G/S 49.83 %) • Plants and Fungi
Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed Danablu (indications géographiques protégées de l'Union européenne) ; Roqueforts (Appellation d'origine • appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Gorgonzolas (Appellation d'origine protégée) ; Fourme d'Ambert (indications géographiques protégées de l'Union européenne) • PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #05 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Marqueurs technologiques (pH et gaz)

🔎 Preuve SQLite
Substrats glucidiques, lactose résiduel (USDA) & métabolites Énergie : 353 kcal ; Protein : 21.4 g ; Ash : 5.11 g ; Fiber, total dietary : 0 g • Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core]
Rôle métabolique & composés caractérisés Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Égouttage, humidité, salage (USDA) & matrices reliées Danablu (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Roqueforts (EST 60.6 %, NaCl 4.6 g/100g) ; Gorgonzolas (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Fourme d'Ambert (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) • Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core]
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Surveillance phagique en cuve & références PubMed Phages: Penicillium roqueforti ssRNA mycovirus 1 (TaxID:1532180) • PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume • Plants and Fungi
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin] • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Danablu (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Roqueforts (EST 60.6 %, MNA 56.77 %, NaCl 4.6 g/100g) ; Gorgonzolas (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Fourme d'Ambert (EST 57.6 %, MNA 59.47 %, NaCl 2.92 g/100g) • Penicillium roqueforti Sopp, 1912
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Terroirs et appellations protégées

🔎 Preuve SQLite
Fromages reliés & bassins laitiers d'origine Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin] • Danemark ; France — Roquefort-sur-Soulzon ; Italie — Lombardie ; Royaume-Uni — Somerset ; Italie
Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes Danablu (indications géographiques protégées de l'Union européenne) ; Roqueforts (Appellation d'origine • appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Gorgonzolas (Appellation d'origine protégée) ; Fourme d'Ambert (indications géographiques protégées de l'Union européenne) • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Fromageries de terroir & palmarès officiels Penicillium roqueforti Sopp, 1912
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Collections de référence, BioSample & BioProject SAMN20133489 • PRJNA745079
Audit de terroir & références PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Volatilome et profils aromatiques

🔎 Preuve SQLite
Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils trimethylamine ; stearic acid ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; palmitic acid ; oleic acid • Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core]
Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) Cholestérol : 75 mg ; Fatty acids, total saturated : 18.7 g ; SFA 16:0 : 9.15 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 7.78 g ; Glutamic acid : 5.18 g ; Proline : 2.1 g ; Leucine : 1.92 g • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume • Ascomycota (phylum) › Eurotiomycetes (class) › Eurotiales (order) › Aspergillaceae (family) › Penicillium (genus)
Accords gastronomiques & affinités sensorielles Candied Pecan ; Head Iceberg Lettuce ; Salad Green ; Endive ; Iceberg Lettuce ; Romaine Lettuce Heart ; Romaine Lettuce ; Filet Mignon Steak • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Cinétique aromatique & études PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
INDEX-EXPERT™ #12 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Gestes de l'affineur et soins de cave

🔎 Preuve SQLite
Conduite de croûte, soins de cave & matrices Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (6 éch.) ; Colonisation douce des fines ouvertures cylindriques conférant un persillage délicat sans amertume • Danablu [da:danablu], Roqueforts / Roquefort cheeses [en:roquefort-cheeses], Gorgonzolas [en:gorgonzolas], Fourme d'Ambert / Fourme d'Ambert cheese from cow's milk [en:fourme-d-ambert-cheese-from-cow-s-milk], Blue cheese [en:blue-cheese], Cheese core [en:cheese-core], Stilton cheese [en:stilton-cheese], Bleu bénédictin [qc:bleu-benedictin]
Équilibre hydrique, extrait sec & salage (USDA) Danablu (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Roqueforts (EST 60.6 %, NaCl 4.6 g/100g) ; Gorgonzolas (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) ; Fourme d'Ambert (EST 57.6 %, NaCl 2.92 g/100g) • Plants and Fungi
Caves d'affinage, fromageries & régions Danemark ; France — Roquefort-sur-Soulzon ; Italie — Lombardie ; Royaume-Uni — Somerset ; Italie
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:5082 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Études de cave & références PubMed PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎

⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (2)

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave (Palier 3 — Praticien) :

⚠️ Agent majeur de moisissure interne
DEFAUT_AFFINAGE_CROUTE🔎 Preuve
Taches et veines feutrées vert-bleuté foncé sur la croûte ou dans les fissures des pâtes non persillées, goût puissant de méthylcétones et de moisi…
Consulter la fiche clinique 360° →
⚠️ Corticale bleue indésirable et de rancissement cétonique hors pâtes persillées
DEFAUT_AFFINAGE_CROUTE🔎 Preuve
Taches et veines feutrées vert-bleuté foncé sur la croûte ou dans les fissures des pâtes non persillées, goût puissant de méthylcétones et de moisi…
Consulter la fiche clinique 360° →

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (2) :
🦠 Penicillium roqueforti FM164 #1365484 🦠 Penicillium roqueforti var. punctatum #1343413

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB PDB #1DGP (3 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_030518555.1 • Taille: 28.7545 Mb • GC: 48.1165 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN20133489 • BioProject: PRJNA745079
Littérature primaire PubMed / DOI PMID:24778615 🔎 • DOI:10.1111/1541-4337.12069 🔎
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cheeses (n=56) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:blue-cheese (n=24) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:gorgonzolas (n=6) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:cheese-core (n=4) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : en:roquefort-cheeses (n=2) 📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) : da:danablu (n=2)