Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #160386 • SPECIES • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #160386
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Corynebacterium casei Corynebacterium casei Brennan et al. 2001
⚡ 9 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 12 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum)
› Actinomycetes (class)
› Mycobacteriales (order)
› Corynebacteriaceae (family)
› Corynebacterium (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (12) :
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™
Palier 1
Index maître des ferments fromagers et affineurs
🔎 Preuve SQLite
| Matrices fromagères & substrats associés | Maroilles [en:maroilles], Oka [qc:oka], Fontina [en:fontina], Parmigiano Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Grana Padano [en:grana-padano], Queso Cotija [en:cotija-cheese], Fromages à pâte pressée cuite [en:hard-cheeses], Tommes [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk] |
|---|---|
| Typologie de pâte & preuves technologiques | Corynéforme dominant de la flore de surface du Maroilles accélérant la protéolyse sous-corticale et la souplesse de la pâte ; Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Bacteria • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus) |
| Métabolites secondaires & collections de référence | GCA_000550785.1 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| EST %, G/S % des matrices fromagères | Taille: 3.13221 Mb • GC: 55.6977 % • Corynebacterium casei Brennan et al. 2001 |
| Bactériophages prédateurs & littérature PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Synonymies et anciens noms (NCBI)
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| Concordance de nomenclature (NCBI) | Corynebacterium casei (Corynebacterium casei Brennan et al. 2001) |
|---|---|
| Synonymes & basionymes historiques | Bacteria |
| Autorité taxonomique & souches de référence | Corynebacterium casei Brennan et al. 2001 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Filiation & justification phylogénomique | Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus) |
| Références taxonomiques PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #02 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Origines et habitacles écologiques
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| Biotope fromager, terroirs & substrats d'isolement | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles] • Italie ; France — Franche-Comté ; Italie — Émilie-Romagne — Lombardie ; Italie — Province de Parme — Émilie-Romagne ; Espagne |
|---|---|
| Souches déposées & collections de référence | Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) |
| EST %, G/S % des matrices colonisées | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Comté (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Grana Padano (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Écologie & références PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Familles de fromages et technologies
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| Famille technologique & appellations associées | Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte pressée cuite ; Fromages espagnols • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles] |
|---|---|
| Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices | Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Comté (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Grana Padano (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria |
| Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed | Oka (Appellation d'origine protégée) ; Comté (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Grana Padano (Appellation d'origine protégée) • Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
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| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | Oka (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Comté (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Grana Padano (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Corynebacterium casei Brennan et al. 2001 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #09 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Interactomes et syntrophie des surfaces
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| Partenaires microbiens de consortium & matrices | Acidipropionibacterium acidipropionici (TaxID:1748) ; Acidipropionibacterium jensenii (TaxID:1749) ; Acidovorax facilis (TaxID:12917) ; Acinetobacter albensis (TaxID:1673609) ; Aerococcus urinaeequi (TaxID:51665) ; Agrococcus casei (TaxID:343512) ; Alkalibacterium gilvum (TaxID:1130080) ; Ancrocorticia populi (TaxID:2175228) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso] |
|---|---|
| Cofacteurs vitaminiques B1–B12 (USDA) & pigments | Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg |
| Typologie des croûtes & succession d'affinage | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Équilibre du consortium & études PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #10 • Architecture Tyrodexia™
Palier 1
Terroirs et appellations protégées
🔎 Preuve SQLite
| Fromages reliés & bassins laitiers d'origine | Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles] • Italie ; France — Franche-Comté ; Italie — Émilie-Romagne — Lombardie ; Italie — Province de Parme — Émilie-Romagne ; Espagne |
|---|---|
| Appellations officielles (AOP/DOP/IGP) & croûtes | Oka (Appellation d'origine protégée) ; Comté (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Grana Padano (Appellation d'origine protégée) ; Parmigiano Reggiano (Appellation d'origine protégée) • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus) |
| Fromageries de terroir & palmarès officiels | Corynebacterium casei Brennan et al. 2001 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Collections de référence, BioSample & BioProject | SAMN23027200 • PRJNA764004 |
| Audit de terroir & références PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #11 • Architecture Tyrodexia™
Palier 5
Volatilome et profils aromatiques
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| Composés aromatiques ponts (FlavorGraph) & volatils | trimethylamine ; salicylic acid ; propionic acid ; phenylacetaldehyde ; phenol ; oleic acid ; octanoic acid ; methanethiol • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso] |
|---|---|
| Précurseurs lipidiques & aminés d'arômes (USDA) | Cholestérol : 30 mg ; Fatty acids, total saturated : 2.82 g ; Fatty acids, total monounsaturated : 1.92 g ; MUFA 18:1 : 1.78 g ; Glutamic acid : 2.21 g ; Proline : 1.6 g ; Leucine : 0.784 g • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus) |
| Accords gastronomiques & affinités sensorielles | Lasagna Noodle ; Manicotti ; Pepperoni ; Crushed Tomato ; Tomato Paste ; Ground Beef ; Bacon Bit • Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Le référentiel du volatilome fromager et de la chémo-sensorialité (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Cinétique aromatique & études PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
INDEX-EXPERT™ #12 • Architecture Tyrodexia™
Palier 2
Gestes de l'affineur et soins de cave
🔎 Preuve SQLite
| Conduite de croûte, soins de cave & matrices | Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles] |
|---|---|
| Équilibre hydrique, extrait sec & salage (USDA) | Oka (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Comté (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Grana Padano (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) • Bacteria |
| Caves d'affinage, fromageries & régions | Italie ; France — Franche-Comté ; Italie — Émilie-Romagne — Lombardie ; Italie — Province de Parme — Émilie-Romagne ; Espagne |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:160386 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Études de cave & références PubMed | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
🔬 Souches subordonnées et sous-espèces qualifiées dans Tyrodexia™ (2) :
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000550785.1 • Taille: 3.13221 Mb • GC: 55.6977 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN23027200 • BioProject: PRJNA764004 |
|---|---|
| Littérature primaire PubMed / DOI | Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"… |
📊 Détections métagénomiques quantitatives (SegataLab/cFMD Cell 2024 & FoodMicrobionet) :
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheeses (n=264)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:fontina (n=12)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:tomme-cheese-from-cow-s-milk (n=8)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:hard-cheeses (n=6)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:parmigiano-reggiano (n=4)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:grana-padano (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cotija-cheese (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:comte (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:abondance (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
es:picon-bejes-tresviso (n=2)
📊 SegataLab/cFMD (Cell 2024) :
en:cheese-core (n=2)