STANDARD V14.4 • ROUTAGE O(1) Architecture relationnelle 24 pôles & 17 Index-Experts™ synchronisés avec la taxonomie NCBI 2026, EBI SIFTS 3D et cFMD/FMBN.
TYRODEXIA™ & NCBI 2026
Grand dictionnaire du microbiome des fromages
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Palier 1 • Identité NCBI 🦠 NCBI TAXID #1110505 • STRAIN • Bacteria 🔎 Certificat NCBI #1110505
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Corynebacterium casei UCMA 3821 Corynebacterium casei Brennan et al. 2001

⚡ 6 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1))  •  🧀 12 matrice(s) fromagère(s) reliée(s)

🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées

Palier 2 • Fromager & Sommelier
Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus)
🧀 Fromages, matrices laitières et appellations reliés (12) :
🧀 Abondance 🧀 Cheese core 🧀 Comté 🧀 Fontina 🧀 Fromages à pâte pressée cuite 🧀 Grana Padano 🧀 Maroilles 🧀 Oka 🧀 Parmigiano Reggiano 🧀 Picon bejes tresviso 🧀 Queso Cotija 🧀 Tommes
INDEX-EXPERT™ #00 • Socle fromager Tyrodexia™ Palier 1

Index maître des ferments fromagers et affineurs

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Matrices fromagères & substrats associés Maroilles [en:maroilles], Oka [qc:oka], Fontina [en:fontina], Parmigiano Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Grana Padano [en:grana-padano], Queso Cotija [en:cotija-cheese], Fromages à pâte pressée cuite [en:hard-cheeses], Tommes [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk]
Typologie de pâte & preuves technologiques Corynéforme dominant de la flore de surface du Maroilles accélérant la protéolyse sous-corticale et la souplesse de la pâte ; Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Bacteria • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus)
Métabolites secondaires & collections de référence GCA_000234765.2
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1110505 • Tyrodexia Microbiota Authority (ref_liens_fromages_microbiote.csv) • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
EST %, G/S % des matrices fromagères Taille: 3.11274 Mb • GC: 55.3 % • Corynebacterium casei Brennan et al. 2001
Bactériophages prédateurs & littérature PubMed Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…
INDEX-EXPERT™ #01 • Architecture Tyrodexia™ Palier 5

Synonymies et anciens noms (NCBI)

🔎 Preuve SQLite
Concordance de nomenclature (NCBI) Corynebacterium casei UCMA 3821 ⟷ Corynebacterium casei strain UCMA 3821 • Corynebacterium casei str. UCMA 3821
Synonymes & basionymes historiques Bacteria
Autorité taxonomique & souches de référence Corynebacterium casei Brennan et al. 2001
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1110505 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Filiation & justification phylogénomique Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus)
Références taxonomiques PubMed Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…
INDEX-EXPERT™ #04 • Architecture Tyrodexia™ Palier 1

Familles de fromages et technologies

🔎 Preuve SQLite
Famille technologique & appellations associées Fromages italiens ; Fromages de vache ; Fromages de France ; Fromages à pâte pressée cuite ; Fromages espagnols • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles]
Diagramme de pâte, croûte & fonction technologique Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1110505 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Extrait sec (EST %) & Gras sur sec (G/S %) des matrices Oka (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) ; Comté (EST 45.3 %, G/S 23.84 %) ; Fontina (EST 62.1 %, G/S 50.08 %) ; Grana Padano (EST 33.2 %, G/S 18.07 %) • Bacteria
Fromages emblématiques (AOP / Caseus) & études PubMed Oka (Appellation d'origine protégée) ; Comté (appellation d'origine contrôlée • Appellation d'origine protégée) ; Fontina (Appellation d'origine protégée) ; Grana Padano (Appellation d'origine protégée) • Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™ Palier 4

Pathogènes et bioprotection

🔎 Preuve SQLite
Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Bacteria
Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles] • Actinomycetota (phylum) › Actinomycetes (class) › Mycobacteriales (order) › Corynebacteriaceae (family) › Corynebacterium (genus)
Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) Oka (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Comté (EST 45.3 %, MNA 61.32 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Grana Padano (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • Corynebacterium casei Brennan et al. 2001 • Corynebacterium casei strain UCMA 3821 • Corynebacterium casei str. UCMA 3821
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1110505 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Prophylaxie & références PubMed Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…
INDEX-EXPERT™ #09 • Architecture Tyrodexia™ Palier 3

Interactomes et syntrophie des surfaces

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Partenaires microbiens de consortium & matrices Acidipropionibacterium acidipropionici (TaxID:1748) ; Acidipropionibacterium jensenii (TaxID:1749) ; Acidovorax facilis (TaxID:12917) ; Acinetobacter albensis (TaxID:1673609) ; Aerococcus urinaeequi (TaxID:51665) ; Agrococcus casei (TaxID:343512) ; Alkalibacterium gilvum (TaxID:1130080) ; Ancrocorticia populi (TaxID:2175228) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso]
Cofacteurs vitaminiques B1–B12 (USDA) & pigments Vitamin A, IU : 496 IU ; Retinol : 40 µg ; Vitamin A, RAE : 58 µg ; Carotene, beta : 218 µg ; Carotene, alpha : 0 µg
Typologie des croûtes & succession d'affinage Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.)
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1110505 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage)
Équilibre du consortium & études PubMed Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…
INDEX-EXPERT™ #12 • Architecture Tyrodexia™ Palier 2

Gestes de l'affineur et soins de cave

🔎 Preuve SQLite
Conduite de croûte, soins de cave & matrices Cheese core (A cheese food product which is surrounded by a cheese rind.) • Co-flore corynéforme des caves d'Oka accélérant la protéolyse de surface et les notes beurrées et fruitées ; Microbiote fromager caractérisé (2 éch.) ; Microbiote fromager caractérisé (12 éch.) • Oka / Oka (fromage) [qc:oka], Comté [en:comte], Fontina [en:fontina], Grana Padano [en:grana-padano], Parmigiano Reggiano / Parmigiano-Reggiano [en:parmigiano-reggiano], Picon bejes tresviso [es:picon-bejes-tresviso], Tommes / Tomme cheese from cow's milk [en:tomme-cheese-from-cow-s-milk], Maroilles [en:maroilles]
Équilibre hydrique, extrait sec & salage (USDA) Oka (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Comté (EST 45.3 %, NaCl 1.22 g/100g) ; Fontina (EST 62.1 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Grana Padano (EST 33.2 %, NaCl 0.94 g/100g) • Bacteria
Caves d'affinage, fromageries & régions Italie ; France — Franche-Comté ; Italie — Émilie-Romagne — Lombardie ; Italie — Province de Parme — Émilie-Romagne ; Espagne
Sources officielles & ouvrage de référence TaxID:1110505 • Atlas de l'ingénierie fromagère et de la thermodynamique d'affinage (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection)
Études de cave & références PubMed Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…

🏛️ Collections mondiales (DSM / ATCC / CBS), Synonymies NCBI, Souches & Races FAO DAD-IS

Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste
Synonymes & Basionymes NCBI Corynebacterium casei strain UCMA 3821 • Corynebacterium casei str. UCMA 3821

🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed

Palier 5 • Expert Absolu
Assemblage Génomique NCBI RefSeq RefSeq: GCA_000234765.2 • Taille: 3.11274 Mb • GC: 55.3 % • Statut: Contig • BioSample: SAMEA2272663 • BioProject: PRJEA76363
Littérature primaire PubMed / DOI Brennan, N.M., Brown, R., Goodfellow, M., Ward, A.C., Beresford, T.P., Simpson, P.J., Fox, P.F., and Cogan, T.M. \"Corynebacterium mooreparkense sp. nov. and Corynebacterium casei sp. nov., isolated from the surface of a smear-ripened cheese.\"…