Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #46126 • SPECIES • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #46126
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Staphylococcus chromogenes Staphylococcus chromogenes (Devriese et al. 1978) Hjek et al. 1987
🌍 Major coagulase-negative mastitis agent causing impaired renneting and orange spot defects ; Agent majeur de mammite subclinique à SCN responsable de défaut de caillage et de ponctuations orangées
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 0 linked cheese matrix/matrices
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Staphylococcaceae (family)
› Staphylococcus (genus)
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits de fromagerie issus de troupeaux à mammites subcliniques, pâtes pressées non cuites et pâtes molles au lait cru
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Staphylococcus chromogenes ⟷ Staphylococcus hyicus subsp. chromogenes |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Major coagulase-negative mastitis agent causing impaired renneting and orange spot defects ; Agent majeur de mammite subclinique à SCN responsable de défaut de caillage et de ponctuations orangées • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | Staphylococcus chromogenes (Devriese et al. 1978) Hjek et al. 1987 |
| Official sources & reference book | TaxID:46126 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:15005591 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent majeur de mammite subclinique à SCN responsable de défaut de caillage et de ponctuations orangées • Allongement du temps de prise à la présure, gel mou retenant le lactosérum, petites colonies pigmentées jaune-orangé en croûte/ouvertures et lipolyse secondaire |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Activation de la plasmine native du lait via la réaction inflammatoire mammaire, sécrétion de lipases/estérases et biosynthèse du caroténoïde staphyloxanthine |
| Documented substrates & historical synonyms | Dépistage des mammites subcliniques et hygiène post-traite des trayons, tri des laits à fort comptage cellulaire et acidification rapide en cuve • Mammites subcliniques persistantes (élévation des cellules somatiques), halotolérance élevée (jusqu'à 12-15 % NaCl), survie à la thermisation |
| Official sources & reference book | TaxID:46126 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 20454, ATCC 43764, NCTC 10530, CIP 81.56 |
| Operator safety & PubMed references | PMID:15005591 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Major coagulase-negative mastitis agent causing impaired renneting and orange spot defects ; Agent majeur de mammite subclinique à SCN responsable de défaut de caillage et de ponctuations orangées • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Laits de fromagerie issus de troupeaux à mammites subcliniques, pâtes pressées non cuites et pâtes molles au lait cru • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Staphylococcus chromogenes (Devriese et al. 1978) Hjek et al. 1987 • Staphylococcus hyicus subsp. chromogenes |
| Official sources & reference book | TaxID:46126 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:15005591 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
⚠️ Cellar Clinical Vigilance & Generic Defects Monitoring (1)
Differential diagnosis of potential defects, biochemical mechanisms and cellar prophylaxis (Tier 3 — Practitioner):
⚠️ Major coagulase-negative mastitis agent causing impaired renneting and orange spot defects
ALTERATION_TECHNOLOGIQUE_CUVE🔎 Proof
Allongement du temps de prise à la présure, gel mou retenant le lactosérum, petites colonies pigmentées jaune-orangé en croûte/ouvertures et lipoly…
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Staphylococcus hyicus subsp. chromogenes |
|---|
🔬 Subordinate strains and subspecies qualified in Tyrodexia™ (1) :
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_007814525.1 • Taille: 2.39457 Mb • GC: 36.8641 % • Statut: Complete Genome • BioSample: SAMN37948662 • BioProject: PRJNA779404 |
|---|---|
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:15005591 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |