Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #1446674 • STRAIN • Bacteria
🔎 NCBI Certificate #1446674
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Escherichia coli O157:H7 str. K2324 "Bacillus coli" Migula 1895
🌍 Shiga toxin-producing E. coli (STEC / VTEC) pathogen ; Agent pathogène STEC / VTEC (producteur de shigatoxines) ; E. coli
⚡ 3 active Index-Experts™ pole(s) (O(1) routing) • 🧀 8 linked cheese matrix/matrices • 🧊 25 3D structure(s) RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Phylogenetic Lineage & Associated Cheese Matrices
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Pseudomonadota (phylum)
› Gammaproteobacteria (class)
› Enterobacterales (order)
› Enterobacteriaceae (family)
› Escherichia (genus)
🧀 Linked cheeses, dairy matrices and designations (8) :
🧫 Isolation Substrates, Biological Hosts & Cellar Ecology (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Fromages au lait cru à pâte molle, pâtes lactiques et pâtes pressées non cuites
INDEX-EXPERT™ #01 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 5
Synonyms and historical names (NCBI)
🔎 SQLite Proof
| Nomenclature concordance (NCBI) | Escherichia coli O157:H7 str. K2324 ⟷ Escherichia coli K2324 |
|---|---|
| Historical synonyms & basionyms | Shiga toxin-producing E. coli (STEC / VTEC) pathogen ; Agent pathogène STEC / VTEC (producteur de shigatoxines) ; E. coli • Bacteria |
| Taxonomic authority & reference strains | "Bacillus coli" Migula 1895 |
| Official sources & reference book | TaxID:1446674 • Le grand dictionnaire du microbiome des fromages (https://www.tyrodexia.com/index.html#ouvrage) |
| Lineage & phylogenomic justification | Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Escherichia (genus) |
| PubMed taxonomic references | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #06 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 3
Symptoms and manufacturing defects
🔎 SQLite Proof
| Vigilance category & defect diagnosis | Agent pathogène STEC / VTEC (producteur de shigatoxines) • Aucun défaut sensoriel systématique aux faibles doses infectieuses ; risque de syndrome hémolytique et urémique (SHU) lié aux sérogroupes O157, O26, O103, O145, O111 • Pecorino [en:pecorino], Fontina [en:fontina], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Lactosérum [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo], Provolone [en:provolone] |
|---|---|
| Spoilage metabolites & taxonomic lineage | Résistance acide dépendante du glutamate (système GadABC) et production de shigatoxines (Stx1, Stx2) codées par des prophages |
| Documented substrates & historical synonyms | Hygiène irréprochable de la traite et de la litière, contrôle PCR stx/eae sur laits et fromages, flores barrières compétitives en cuve • Tolérance extrême à l'acidité (survie à pH 4.2-4.5 dans les caillés lactiques), T° de fabrication > 20 °C, contamination fécale à la traite |
| Official sources & reference book | TaxID:1446674 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Reference strain collections | DSM 30083, ATCC 11775, NCTC 9001 (EDL933 STEC : ATCC 43895) |
| Operator safety & PubMed references | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Tyrodexia™ Architecture
Palier 4
Pathogens and bioprotection
🔎 SQLite Proof
| Bacteriocins (NPClassifier) & health targets | Flore de vigilance métagénomique (2 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (6 éch.) ; Flore de vigilance métagénomique (12 éch.) • Shiga toxin-producing E. coli (STEC / VTEC) pathogen ; Agent pathogène STEC / VTEC (producteur de shigatoxines) ; E. coli • Bacteria |
|---|---|
| Isolation substrates & linked cheese matrices | Fromages au lait cru à pâte molle, pâtes lactiques et pâtes pressées non cuites • Fontina [en:fontina], Mozzarella [en:mozzarella], Fiore sardo [it:fiore-sardo], Pecorino [en:pecorino], Cheddars / Cheddar cheese [en:cheddar-cheese], Provolone [en:provolone], Lactosérum / Whey [en:whey], Caciocavallo [en:caciocavallo] • Pseudomonadota (phylum) › Gammaproteobacteria (class) › Enterobacterales (order) › Enterobacteriaceae (family) › Escherichia (genus) |
| Physicochemical barriers (TDM, moisture, NaCl USDA) | Fontina (EST 62.1 %, MNA 55.01 %, NaCl 2.03 g/100g) ; Mozzarella (EST 50.0 %, MNA 64.18 %, NaCl 1.23 g/100g) ; Fiore sardo (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) ; Pecorino (EST 33.2 %, MNA 71.06 %, NaCl 0.94 g/100g) • "Bacillus coli" Migula 1895 • Escherichia coli K2324 |
| Official sources & reference book | TaxID:1446674 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxis & PubMed references | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |
🏛️ Global Culture Collections (DSM / ATCC / CBS), NCBI Synonyms, Strains & FAO DAD-IS Breeds
Palier 4 • Institutionnel & Microbiologiste| NCBI Synonyms & Basionyms | Escherichia coli K2324 |
|---|
🧬 RefSeq Genomics, 3D Structural Biology (EBI SIFTS), Metagenomics (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| EBI SIFTS / RCSB PDB 3D Structures | PDB #10EC (25 crystallographic structures • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| NCBI RefSeq Genomic Assembly | RefSeq: GCA_000618665.1 • Taille: 5.29806 Mb • GC: 50.4 % • Statut: Contig • BioSample: SAMN02353098 • BioProject: PRJNA218110 |
| PubMed / DOI Primary Literature | PMID:25085216 🔎 • DOI:10.1016/j.ijfoodmicro.2014.07.011 🔎 |