Palier 1 • Identité NCBI
🦠 NCBI TAXID #904330 • STRAIN • Bacteria
🔎 Certificat NCBI #904330
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Staphylococcus epidermidis VCU109 "Albococcus epidermidis" Winslow and Winslow 1908
🌍 Coagulase-negative mastitis agent causing curd destabilization and biogenic amine accumulation ; Agent de mammite subclinique à staphylocoques à coagulase négative et producteur d'amines biogènes
⚡ 2 pôle(s) d'Index-Experts™ actifs (routage O(1)) • 🧀 0 matrice(s) fromagère(s) reliée(s) • 🧊 25 structure(s) 3D RCSB PDB / EBI SIFTS
🌳 Filiation phylogénétique & Matrices fromagères associées
Palier 2 • Fromager & Sommelier
Bacillota (phylum)
› Bacilli (class)
› Caryophanales (order)
› Staphylococcaceae (family)
› Staphylococcus (genus)
🧫 Substrats d'isolement, Hôtes biologiques & Écologie de cave (NCBI Host)
Palier 3 • Praticien & Affineur
Laits de fromagerie à taux cellulaire élevé, pâtes pressées non cuites et pâtes molles au lait cru
INDEX-EXPERT™ #06 • Architecture Tyrodexia™
Palier 3
Symptômes et défauts de fabrication
🔎 Preuve SQLite
| Catégorie de vigilance & diagnostic de défaut | Agent de mammite subclinique à staphylocoques à coagulase négative et producteur d'amines biogènes • Ralentissement de la synérèse en cuve (via l'inflammation mammaire), lipolyse secondaire rance et accumulation de tyramine, phényléthylamine et histamine |
|---|---|
| Métabolites d'altération & filiation taxonomique | Sécrétion de lipases extracellulaires (GehC/GehD), d'une métalloprotéase (SepA), formation de biofilms (PIA/icaADBC) et activité aminoacide décarboxylase chez les souches laitières |
| Substrats documentés & synonymes historiques | Hygiène de la traite (trempage des trayons), maîtrise des mammites subcliniques, refroidissement rapide du lait et acidification lactique franche • Mammites subcliniques ou contamination cutanée des trayons et des mains des opérateurs, halotolérance élevée (jusqu'à 10-15 % NaCl), biofilms sur équipements |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:904330 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Collections de souches de référence | DSM 20044, ATCC 14990, NCTC 11047, CIP 81.55 |
| Sécurité opérateur & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
INDEX-EXPERT™ #08 • Architecture Tyrodexia™
Palier 4
Pathogènes et bioprotection
🔎 Preuve SQLite
| Bactériocines (NPClassifier) & cibles sanitaires | Coagulase-negative mastitis agent causing curd destabilization and biogenic amine accumulation ; Agent de mammite subclinique à staphylocoques à coagulase négative et producteur d'amines biogènes • Bacteria |
|---|---|
| Substrats d'isolement & matrices fromagères reliées | Laits de fromagerie à taux cellulaire élevé, pâtes pressées non cuites et pâtes molles au lait cru • Bacillota (phylum) › Bacilli (class) › Caryophanales (order) › Staphylococcaceae (family) › Staphylococcus (genus) |
| Barrières physico-chimiques (EST, humidité, NaCl USDA) | "Albococcus epidermidis" Winslow and Winslow 1908 |
| Sources officielles & ouvrage de référence | TaxID:904330 • Le manuel clinique des pathologies laitières et fromagères (https://www.tyrodexia.com/index.html#collection) |
| Prophylaxie & références PubMed | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |
🧬 Génomique RefSeq, Biologie Structurale 3D (EBI SIFTS), Métagénomique (cFMD/FMBN) & PubMed
Palier 5 • Expert Absolu| Structures 3D EBI SIFTS / RCSB PDB | PDB #1G5Q (25 structures cristallographiques • CIF) — RCSB PDB 3D ↗ |
|---|---|
| Assemblage Génomique NCBI RefSeq | RefSeq: GCA_000221665.2 • Taille: 2.3905 Mb • GC: 32.1 % • Statut: Contig • BioSample: SAMN00116832 • BioProject: PRJNA53741 |
| Littérature primaire PubMed / DOI | PMID:19896784 🔎 • DOI:10.3168/jds.2010-3850 🔎 |