Parution prochaine Édition inaugurale : Lancement prochain du livre Le grand dictionnaire du microbiome des fromages — Campagne imminente pour nos 5 grands maîtres fromagers tutélaires (priorité au Québec).
🎛️ Sélection du Profil 🧀 Maître fromager / affineur
Paramètres technologiques (EST, G/S, MNA, Ca/P, NaCl), ferments (#00), cuve, soins de cave et vigilance clinique (Index 06).
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← Retour à l'accueil ◀ TaxID 548 🔎 NCBI #549 TaxID 550 ▶
Filiation évolutive : cellular organisms/ Bacteria/ Pseudomonadati/ Pseudomonadota/ Gammaproteobacteria/ Enterobacterales/ Erwiniaceae/ Pantoea/ Pantoea agglomerans group/ Pantoea agglomerans
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Pantoea agglomerans

🔎 Preuve et source primaire (#549) Pantoea agglomerans (Beijerinck 1888) Gavini et al. 1989
NCBI Taxonomy #549 ↗ NCBI Datasets ↗ Europe PMC ↗ GBIF ↗
✔ 3 Index-Experts™ Bactéries de vigilance laitière et fromagère (Bacteria) • espèce
Synthèse fonctionnelle Tyrodexia™ : Symptômes et défauts de fabrication (Agent entérobactérien fourrager de gonflement précoce et de ponctuations jaunes corticales) • Synonymies et anciens noms (NCBI) (Pantoea agglomerans ⟷ Bacterium herbicola) • Pathogènes et bioprotection (Fromages au lait cru à pâte molle ou pressée non cuite (Saint-Nectaire, Tomme, Cantal, Reblochon), fromages de chèvre)

🔮 Concepts Holographiques 360° & Biomarqueurs Reliés (3)

Révisions taxonomiques et synonymies officielles NCBI360° →
Enzyme d'acidification, de transport du citrate ou de décarboxylation360° →
Consortium de 19 bactériophages lytiques / tempérés360° →

⚠️ Vigilance Clinique de Cave & Altérations Génériques (1)

Diagnostic différentiel des altérations potentielles, mécanismes biochimiques et prophylaxie de cave :

Ouverture précoce irrégulière en petits trous, colonies ou taches jaunâtres sous la croûte et goût herbeux-amer
GenomeNet Virus-Host DB (Kyoto Univ.) & Index-Expert™ #07

🧬 Bactériophages prédateurs et virome laitier ciblant cet organisme (19)

🧬 Erwinia phage KEY #2821255 🔎 🧬 Pantoea bacteriophage TacPo2 #3134916 🔎 🧬 Pantoea phage G19 #3416021 🔎 🧬 Pantoea phage LIMElight #881915 🔎 🧬 Pantoea phage LIMEzero #943335 🔎 🧬 Pantoea phage Nafs113 #2894291 🔎 🧬 Pantoea phage Nifs112 #2894289 🔎 🧬 Pantoea phage Nufs112 #2894290 🔎 🧬 Pantoea phage ROV85 #3134915 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagM_AAM22 #2588092 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagM_AAM37 #2588093 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagM_LIET2 #2508071 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagM_PSKM #2588094 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagM_SSEM1 #2721760 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagP-SK1 #2653646 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagS_AAS21 #2575261 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagS_AAS23 #2499073 🔎 🧬 Pantoea phage vB_PagS_MED16 #2499074 🔎
EBI SIFTS / RCSB Protein Data Bank (wwPDB)

🧊 Structures moléculaires et cristallographiques 3D (9)

🔎 SIFTS / PDB 🧊 Mol* (#1C7G) ↗
PDB #1C7G ↗ PDB #3HGU ↗ PDB #3HGV ↗ PDB #3L2K ↗ PDB #3SK1 ↗ PDB #3SK2 ↗ PDB #3UNV ↗ PDB #5FF5 ↗ PDB #7FJK ↗
NCBI RefSeq / GenBank

🧬 Architecture génomique et assemblage de référence

🔎 RefSeq
Taille mb
4.69202 ↗
Gc pourcent
55.0741 ↗
Nb genes
4354 ↗
Nb proteines
4198 ↗
Statut assemblage
Complete Genome ↗
Accession refseq
GCA_019048385.1 ↗
Souche sequencee
FDAARGOS 1447 ↗
Institut / Centre de séquençage
Nanjing University of Finance and Economics ↗
Programme BioProject NCBI
PRJNA977094 ↗
Groupe métabolique NCBI
Pseudomonadota / Gammaproteobacteria ↗
🧬 Table de traduction du code génétique (NCBI) ↗
Bacterial, Archaeal and Plant Plastid
🌿 Souches, sous-espèces et taxons subordonnés dans le périmètre fromager (8 / 8)
🏷️ Synonymes historiques, basionymes et souches de collections (NCBI) (7 / 7)
synonym : Bacterium herbicola 🔎 synonym : Enterobacter agglomerans 🔎 synonym : Erwinia herbicola 🔎 synonym : Erwinia milletiae (Kawakami and Yoshida 1920) Magrou 1937 (Approved Lists 1980) 🔎 synonym : Erwinia milletiae 🔎 synonym : Pantoea herbicola 🔎 synonym : Pseudomonas herbicola 🔎
Littérature scientifique spécialisée ...